一般の御朱印帳に書いていただける御朱印と、「洛陽三十三所観音巡礼」で書いていただける御朱印があります。清水寺本堂、善光寺堂、朝倉堂、泰産寺の御朱印は、本堂の横にある納経所でいただくことができます。参拝の順番によっては、お参りよりも先に御朱印をいただくことになりますが、本来は参拝をしてから御朱印をいただくというのが正式な順序です。

西国三十三所観音霊場第十六番札所、洛陽三十三所観音霊場第十二番札所となっています。

音羽の滝の前の瀧堂朱印所でいただけるのが、不動明王と書かれた御朱印です。

鮮やかな丹塗りのお堂が目を引く阿弥陀堂。鮮やかな装飾を見るのも楽しみのひとつ。阿弥陀如来坐像がご本尊です。

法然上人二十五霊場第十三番札所となっている阿弥陀堂。阿弥陀如来と書かれています。阿弥陀堂の受付にていただくことができます。

奥の院は、境内の一番奥の音羽の滝の上手にあります。清水の舞台を撮影するなら、奥の院からの眺めがベストスポットです。本堂を模した舞台造りとなっていて、千手観音、地蔵菩薩、毘沙門天、二十八部衆と風神雷神が祀られています。また、弘法大師を祀るお堂としても有名です。

洛陽三十三所観音霊場第十一番札所の御朱印です。奥の院の御朱印は、奥の院にある納経所でいただけます。

清水寺の正門「仁王門」の左手前に、善光寺堂があります。如意輪観音像が祀られています。観光客は素通りしてしまうことが多いので、ゆっくりと参拝することができます。洛陽三十三所観音霊場第十番札所です。

朝倉堂は、越前の守護大名・朝倉貞景が寄進したものです。千手観音、地蔵菩薩、毘沙門天が祀られていますが、通常は非公開です。すぐ横にお釈迦様の足型が彫刻された「仏足石」があり、足腰が悪い人がそれを撫で、その手で自分の足腰を撫でると良くなるといわれています。洛陽三十三所観音霊場第十三番札所です。

本堂に対面する形で見える三重塔（子安塔）と、その前にあるのが泰産寺です。子安塔には胎内に小観音を宿す千手観音が祀られ、安産の祈願塔として有名です。泰産寺内の仏殿には千手観音、地蔵菩薩、毘沙門天、二十八部衆と風神雷神が祀られています。洛陽三十三所観音霊場第十四番札所である清水寺泰産寺です。

納経所では、清水寺オリジナルの紺とエンジの2色の御朱印帖を購入することが出来ます。清水の舞台が箔押しされているデザインが人気です。
こちらの写真の御朱印帖は、洛陽三十三所観音巡礼専用のものです。善光寺堂、朝倉堂、泰産堂、そして本堂と奥の院の御朱印をいただくことができます。シンプルな紺色の蛇腹折りになっているタイプもあり、三十三所の各札所にて販売されています。

詳しくは寺院にお問合せください。